Sus obras juveniles Ciencia Española (3 v.) e Historia de los heterodoxos españoles (8 v.) le dieron fama universal, aunque también fueron la base para el mito de católico intransigente. Sus obras principales, sin embargo, las de su madurez y verdaderamente trascendentes, versan sobre la historia y la crítica de la literatura española y sobre filosofía y pensamiento español. Como una introducción general a todo ello puede considerarse la Historia de las ideas estéticas en España (6 v.) que también trata de las de Europa, trabajo que según George F. Saintsbury ocupa absolutamente el primer lugar en la materia.
Los Estudios sobre el teatro de Lope de Vega (6 v.) contienen en realidad la historia del teatro español. Su Antología de poetas líricos castellanos (10 v.) es la primera historia crítica de la poesía española desde su origen hasta el Renacimiento. Los orígenes de la novela (4 v.), asombroso estudio de literatura comparada, comprende la historia y la crítica de la novela hasta El Quijote. Otros escritos suyos son la Historia de la poesía hispano-americana (2 v.), primera sistematización sobre el tema, Estudios y discursos de crítica histórica y literaria (6 v.), Ensayos de crítica filosófica (1 v.), y los trabajos bibliográficos Bibliografía hispano-latina clásica (10 v.) y la Biblioteca de traductores españoles (4 v.).
El fundador de la historia de la filosofía y el pensamiento español, bajo cuya inspiración todavía vivimos los que nos dedicamos a estas tareas.
(José Luis Abellán)
Creador de la historia de nuestra literatura: pobló un espacio inmenso de la cultura española, antes casi desierto; y nos dejó en su obra un tesoro que ni aun podemos inventariar y un modelo intocable y perenne.
(Dámaso Alonso)
A pesar de esta inmensa labor, lo que él más estimaba era su Biblioteca,
obra de mi paciente esfuerzo, única obra mía de la que me encuentro medianamente satisfecho.
Obras completas
Sus obras escritas comprenden 67 gruesos volúmenes en la Edición Nacional realizada por el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) entre 1940 y 1974. Fue dirigida por Miguel Artigas, Ángel González Palencia y Rafael de Balbín Lucas y editada por Enrique Sánchez Reyes, que añade un tomo con la biografía del autor.
- Historia de las ideas estéticas en España (1-5) 5 v., 1940.
- Estudios y discursos de crítica histórica y literaria (6-12) 7 v., 1942.
- Orígenes de la novela (13-16) 4 v., 1943.
- Antología de poetas líricos castellanos (17-26) 10 v., 1944.
- Historia de la poesía hispano-americana (27-28) 2 v., 1948.
- Estudios sobre el teatro de Lope de Vega (29-34) 6 v., 1949.
- Historia de los heterodoxos españoles (35-42) 8 v., 1948.
- Ensayos de crítica filosófica (43) 1 v., 1948.
- Bibliografía hispano-latina clásica (44-53) 10 v., 1952.
- Biblioteca de traductores españoles (54- 57) 4 v., 1952-1953.
- La ciencia española (58-60) 3 v., 1953-1954.
- Poesías (61-62) 2 v., 1955.
- Varia (63-65) 3 v., 1956-1959.
- Biografía de Menéndez Pelayo por Enrique Sánchez Reyes (66) 1 v., 1974.
- Dramas de Guillermo Shakespeare, trad. (67) 1 v., 1974.
También está editado el Epistolario General de Menéndez Pelayo. Edición al cuidado de Manuel Revuelta Sañudo. Madrid, Fundación Universitaria Española, 1982-1991. 23 v.
Además se puede consultar:
- Bibliografía de estudios sobre Menéndez Pelayo de Amancio Labandeira Fernández, Jerónimo Herrera Navarro y Julio Escribano Hernández. Madrid, Fundación Universitaria Española, 1995.
- Bibliografía sobre Menéndez Pelayo y su Biblioteca (1973-1994) de Rosa Fernández Lera y Andrés del Rey Sayagués. En Boletín de la Biblioteca de Menéndez Pelayo LXXI, 1995.
- Bibliografía sobre Menéndez Pelayo y su Biblioteca (1995-2005) de Rosa Fernández Lera y Andrés del Rey Sayagués. Santander, Biblioteca de Menéndez Pelayo, 2006 (De re bibliographica. Menéndez Pelayo y su Biblioteca, 1).
